Organ upravljanja u Gimnaziji je Školski odbor Gimnazije.
Školski odbor Gimnazije broji pet (5) članova:
* Omerbašić Sabahudin – predsjednik, iz reda osnivača
* Demirović Azelma – član iz reda lokalne zajednice
* Šabanović Harijeta – član iz reda nastavnika,stručnih saradnika i saradnika škole
* Sinanović Besima – član iz reda nastavnika,stručnih saradnika i saradnika škole
* Čajić Nermina – član iz reda roditelja
Presjednika i članove Školskog odbora imenuje i razrješava osnivač i imenuju se za vrijeme od četiri (4) godine i mogu biti najviše dva puta imenovani u Školski odbor.
Školski odbor odluke donosi nadpolovičnom većinom glasova svih članova.
Poslovi Školskog odbora Gimnazije (Pravila Gimnazije „Musa Ćazim Ćatić“, član 120):
* Donosi pravila i druga akta Gimnazije
* Imenuje i razriješava direktora Gimnazije
* Raspisuje konkurs za izbor nastavnika i stručnih saradnika i vrši njihov izbor na prijedlog direktora
* Donosi godišnji program rada Gimnazije i usvaja izvještaje o njegovoj primjeni
* Odlučuje o prestanku prava nastavnika i stručnih saradnika na dalji obrazovno-odgojni rad u nastavi
* Odlučuje o korištenju raspoloživih sredstava škole u skladu sa zakonom
* Donosi odluku o broju, organiziranju i ukidanju odljenja
* Utvrđuje prijedlog plana upisa učenika
* Podnosi izvještaj o uspjehu i postignutim rezultatima obrazovno odgojnog rada kao i materijalnom
poslovanju Gimnazije Ministarstvu obrazovanja
* Prati opći uspjeh učenika i preduzima mjere na poboljšanju radnih uvjeta u školi i nastavi
* Donosi Pravilnik o kućnomm redu Gimnazije
* Odlučuje, na prijedlog nastavničkog vijeća ili direktora, o prigovoru nastavnika, stručnih saradnika i
saradnika na izjavljenu ocjenu o radu
* Daje tumačenje općih akata Gimnazije
* Dodjeljuje nagrade zaposlenicima i učenicima za postignute rezultate u radu i jubilarne nagrade
zaposlenicima
* Donosi opšti akt o unutrašnjoj organizaciji i sistematizaciji poslova i druge opšte akte u skladu sa
zakonom i Pravilima Gimnazije
* Usmjerava, kontroliše i ocjenjuje rad direktora Gimnazije
* Rješava sva pitanja odnosa sa osnivačem
* Odgovara osnivaču za rezultate rada Gimnazije
* odlučuje o prigovoru roditelj, odnosno staratelja učenika na rad nastavnika i stručnih saradanika
* odlučuje o prigovorima i žalbama zaposlenika
* odlučuje o žalbama učenika, roditelja, odnosno staratelja učenika na odgojno- disciplinske mjere
ukor nastavničkog vijeća i isključenje iz Gimnazije
* odlučuje o svim pitanjima obavljanja obrazovno-odgojne djelatnosti radi koje je Gimnazija osnovana,
ako zakonom nije određeno da o određenim pitanjima odlučuje drugi organ Gimnazije